Nelehký osud chrámu začal už jeho stavbou, během níž zemřel architekt J. B. Alliprandi. V historii kostel hned čtyřikrát vyhořel a na přívětivější časy se mu začalo blýskat až v letech 2011-2015, kdy prošel velkorysou rekonstrukcí. Architekt Marek Štěpán baroknímu skvostu navrátil nejen důstojný prostor k rozjímání, ale vytvořil z něj expozici církevního umění a kulturní síň.